工程機器代理進口報關公司流程分析如下：
1. 準備資料：首先需要準備好進口工程機器的相關資料，包括合同、發票、裝箱單、運輸單據等。
2. 檢驗檢疫：進口工程機器需要進行檢驗檢疫，包括檢驗設備是否符合國家標準、是否存在安全隱患等。
3. 申報報關：將準備好的資料提交給報關代理公司，由代理公司進行申報報關。
4. 繳納稅款：根據進口工程機器的稅率，繳納相應的稅款。
5. 收取貨物：報關代理公司完成報關手續后，可以前往海關指定的地點收取貨物。
6. 交付客戶：將貨物交付給客戶，并提供相關的報關單據和發票等。
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